Minor-Studienprogramm Bioinformatik

Die Bioinformatik behandelt Fragestellungen aus den Bereichen Biologie, Biochemie, Biomedizin, Human- und Veterinärmedizin unter Verwendung von informationstechnologischen Methoden. Obwohl computergestützte Methoden schon seit langem in den Life Sciences verwendet werden, hat sich die Bioinformatik vor allem in den letzten Jahren als eigenständiges Fach etabliert. Insbesondere die enorme Datenflut, die durch die Erforschung vollständiger Genomsequenzen ausgelöst wurde, hat die Entwicklung dieses Fachgebietes nachhaltig beeinflusst. Die Bioinformatik umfasst sowohl die Entwicklung von Datenbanken und Algorithmen für die Datenanalyse, als auch die Erforschung biologischer und medizinischer Phänomene mit computergestützten Methoden.  

Das Minor-Studienprogramm Bioinformatik kann sowohl von Studierenden mit Major-Studienprogramm Biologie, Biochemie, Biomedizin oder Chemie als auch von Studierenden mit einem anderen Major-Studienprogramm, z.B. Informatik, besucht werden.

Grundkenntnisse in Molekularbiologie (z.B. BIO 111 oder BIO 117), Biochemie (z.B. BCH 201 oder BCH 210), Evolutionsbiologie (z.B. BIO 113), Linearer Algebra (z.B. MAT  141) und Stochastik (z.B. MAT 183) werden vorausgesetzt.

Das Minor-Studienprogramm Bioinformatik 30 ECTS kann entweder im Bachelorstudiengang oder im Masterstudiengang belegt werden, aber nicht in beiden. 

Die Absolventinnen und Absolventen eines Minor-Studienprogramms Bioinformatik (30 ECTS Credits) sind in der Lage,

• Computerprogramme mässiger Komplexität in einer höheren Programmiersprache zu verfassen, und diese Programme dazu zu benutzen, biologische Datensätze zu analysieren.
• eine biologische Fragestellung in ein solches Programm umzusetzen und durch Analyse biologischer Daten zu beantworten.
• Grundbegriffe der Bioinformatik zu erklären, und wichtige Algorithmen zur bioinformatischen Datenanalyse zu verstehen,
• zu einem bioinformatischem Thema aus der Literatur die relevanten Informationen herauszuarbeiten, und diese schriftlich und mündlich in der Fachsprache zu kommunizieren.
• Verschiedene Datensätze aus Internet-basierenden Datenbanken zu akquirieren und zu integrieren

Das Studium im Minor-Studienprogramm Bioinformatik ist durch Reglemente der Mathematisch-naturwissenschaftlichen Fakultät (MNF) geregelt:

Studienordnung der MNF: Sie enthält alle Bestimmungen für das Minor-Studienprogramm Bioinformatik.

Rahmenverordnung der MNF: Die Rahmenverordnung regelt alle Studiengänge an der MNF.

Das Minor-Studienprogramm Bioinformatik kann nicht kombiniert werden mit einem der Minor-Studienprogramme Neuroinformatik, Simulationen in den Naturwissenschaften, Datenanalyse in den Naturwissenschaften.

Im Minor-Studienprogramm Computational Science 60 ECTS werden zwei Anwendungsfelder aus folgender Liste ausgewählt:

• Bioinformatik
• Neuroinformatik 
• Simulationen in den Naturwissenschaften 
• Datenanalyse in den Naturwissenschaften

• Specialised Master Program in Computational Biology and Bioinformatics (joint degree UZH and ETHZ)
• Specialised Master Program in Biostatistics

Englisch

Pflichtmodule (8 ECTS):

• BIO 390 Introduction to Bioinformatics (3 ECTS, Herbstsemester, Dienstag 8-10, E) 
• *BIO 134 Programming in Biology (5 ECTS, Herbstsemester, Dienstag oder Donnerstag 13-17, E)

*Erlassen für Studierende, die in ihrem Major-Studienprogramm bzw. im Bachelorstudium schon eine Einführung ins Programmieren mit Python absolviert haben (z.B. MAT 101 Programming, AINF 1166 Informatik I, CHE103 Computer Applications in Chemistry). In diesen Fall werden die 5 ECTS aus weiteren Wahlmodulen ergänzt.

Wahlpflichtmodule (mindestens 15 ECTS):

Wahlpflichtmodule Grundlagen der Informatik bzw. der Biologie:

Komplementär zum Major-Studienprogramm muss ein Modul aus der folgenden Liste absolviert werden:

• BIO 117 Molekulare und klassische Genetik für nicht-Biologiestudierende (4 ECTS, Herbstsemester, Mo und Mi 8-10, D und E)
• AINF 1170 Foundations of Computing (6 ECTS, Frühlingssemester, E)
• BINF 2160 Datenbanksysteme (6 ECTS, Frühlingssemester, D)

Wahlpflichtmodule Bioinformatik:

Mindesten 6 ECTS müssen aus der folgenden Liste erworben werden:

• BIO 334 Practical Bioinformatics (6 ECTS, Frühlingssemester, Blockkurs im 4. Viertel)*
• BIO 351 Principles of Evolution: Theory (6 ECTS, Herbstsemester, Blockkurs im 3. Viertel)*
• BIO 445 Quantitative Life Sciences: from infectious diseases to ecosystems (6 ECTS, Herbstsemester, Blockkurs im 4. Viertel)*
• BIO 392 Bioinformatics of Molecular Sequence Variations (6 ECTS, Herbstsemester, Blockkurs im 1. Viertel)*
• BIO 394 Interdisciplinary Research Methods in Computational Biology (4 ECTS, Frühlingssemester, Mo 10-13)*
• BCH 304 Protein Biophysics (6 ECTS, Frühlingssemester, Montag und Dienstag 8-10)
• ETH 701-1418-00L Modeling in Population and Evolutionary Biology (4 ECTS, Blockkurs im Juni, E)*
• ETH 636-0009-00L Evolutionary Dynamics (5 ECTS, Herbstsemester, Donnerstag 10-14, E)

* Diese Module haben eine beschränkte Platzzahl und spezielle Anmeldeverfahren, siehe Vorlesungsverzeichnis. Ein Platz kann nicht garantiert werden, obwohl allen Studierenden des Minors Bioinformatik, die die entsprechenden Grundlagen mitbringen (Grundstudium oder BSc Biologie, Biomedizin oder Biochemie abgeschlossen) und sich rechtzeitig anmelden, wenn immer möglich der Besuch von entweder BIO334 oder BIO351 ermöglicht wird.

Wahlpflichtmodule Statistik:

Ein Modul aus der folgenden Liste muss absolviert werden:

• STA 110 Introduction to Probability (5 ECTS, Frühlingssemester, Montag 13-16, E)
• STA 120 Introduction to Statistics (5 ECTS, Frühlingssemester, Dienstag 10-13, E)
• STA 121 Statistical Modeling (5 ECTS, Herbstsemester, Montag 8-11, E, setzt STA 120 voraus)
• PHY 231 Datenanalyse I (3 ECTS, Herbstsemester, Dienstag 9-10 und 15-17) und
  PHY 241 Datenanalyse II (2 ECTS, Frühlingssemester, Dienstag 10-12)

Wahlmodule:

Die restlichen ECTS können mit Modulen aus dem Pflicht-, Wahlpflicht- und Wahlbereich des Minor-Studienprogramms Computational Science 60 ECTS erworben werden (Liste siehe https://www.ics.uzh.ch/en/studying/bsc/compsci-min.html). Als mögliche Wahlmodule gelten auch die oben aufgeführten Wahlpflichtmodule Bioinformatik sowie die folgenden Module:

• BIO 325 Systems Dynamics in Cell and Developmental Biology (6 ECTS, Herbstsemester, Blockkurs im 2. Viertel)
• BIO 373 Evolutionary and Ecological Genomics using Next Generation Sequencing (6 ECTS, Herbstsemester, Blockkurs im 1. Viertel) 
• BIO 395 The Physics of Life (3 ECTS, Frühlingssemester, Montag 13-15)

Für allgemeine Fragen zum Studienprogramm und zu Major-Minor-Studienprogramm Kombinationen:

PD Dr. Karin Isler

Studienkoordination Biologie

Email: studienkoordination@biol.uzh.ch

Tel: 044 635 48 63

Prof. Dr. Andreas Wagner

Institut für Evolutionsbiologie und Umweltwissenschaften

Email: andreas.wagner@ieu.uzh.ch